Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NOTOA8MTQ0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms