Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PRAMEF25A6NGN4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PRAMEF25A6NGN4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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