Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A4Q9Y6R1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A4Q9Y6R1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms