Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN6Q9Y6Q1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms