Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USH1CQ9Y6N9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USH1CQ9Y6N9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms