Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX13Q9Y5W8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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