Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP16Q9Y5T5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP16Q9Y5T5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP16Q9Y5T5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP16Q9Y5T5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms