Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFE2L3Q9Y4A8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFE2L3Q9Y4A8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFE2L3Q9Y4A8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms