Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF3AQ9Y496 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KIF3AQ9Y496 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms