Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP3Q9Y2W7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP3Q9Y2W7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms