Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP20Q9Y2K6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP20Q9Y2K6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP20Q9Y2K6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms