Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIKFYVEQ9Y2I7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms