Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2BQ9Y287 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITM2BQ9Y287 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITM2BQ9Y287 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITM2BQ9Y287 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITM2BQ9Y287 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITM2BQ9Y287 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms