Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF3IP3Q9Y228 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF3IP3Q9Y228 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms