Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC3Q9UQE7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC3Q9UQE7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms