Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTNND2Q9UQB3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNND2Q9UQB3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNND2Q9UQB3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms