Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPS5Q9UPZ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPS5Q9UPZ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPS5Q9UPZ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms