Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SHANK2Q9UPX8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
SHANK2Q9UPX8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SHANK2Q9UPX8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SHANK2Q9UPX8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms