Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP22Q9UPT9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms