Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNZ2

NSFL1C, NSFL1 cofactor p47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFL1CQ9UNZ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSFL1CQ9UNZ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSFL1CQ9UNZ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NSFL1CQ9UNZ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NSFL1CQ9UNZ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NSFL1CQ9UNZ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NSFL1CQ9UNZ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSFL1CQ9UNZ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSFL1CQ9UNZ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms