Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PADI3Q9ULW8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PADI3Q9ULW8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PADI3Q9ULW8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms