Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG4Q9ULP0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDRG4Q9ULP0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms