Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MED23Q9ULK4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MED23Q9ULK4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms