Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL46

PSME2, Proteasome activator complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME2Q9UL46 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSME2Q9UL46 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSME2Q9UL46 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSME2Q9UL46 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME2Q9UL46 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME2Q9UL46 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSME2Q9UL46 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME2Q9UL46 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSME2Q9UL46 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms