Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMFRQ9UKV5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMFRQ9UKV5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321.9 ms