Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBD1Q9UJT1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBD1Q9UJT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBD1Q9UJT1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms