Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
STAG3Q9UJ98 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
STAG3Q9UJ98 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
STAG3Q9UJ98 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
STAG3Q9UJ98 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms