Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX4Q9UIU6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX4Q9UIU6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX4Q9UIU6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms