Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHF11Q9UIL8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF11Q9UIL8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms