Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP25Q9UHP3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP25Q9UHP3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP25Q9UHP3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP25Q9UHP3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP25Q9UHP3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms