Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFF4Q9UHB7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF4Q9UHB7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF4Q9UHB7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms