Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms