Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM10Q9UDY6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM10Q9UDY6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM10Q9UDY6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms