Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC4Q9UBN4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPC4Q9UBN4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPC4Q9UBN4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms