Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SAE1Q9UBE0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAE1Q9UBE0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms