Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCOR3Q9P2K3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCOR3Q9P2K3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms