Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RRBP1Q9P2E9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RRBP1Q9P2E9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
RRBP1Q9P2E9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRBP1Q9P2E9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms