Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABI3Q9P2A4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABI3Q9P2A4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABI3Q9P2A4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms