Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCHIP1Q9P0W5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCHIP1Q9P0W5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCHIP1Q9P0W5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms