Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM9Q9NXL9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCM9Q9NXL9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms