Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOR4AQ9NXH8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TOR4AQ9NXH8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms