Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT4Q9NX09 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT4Q9NX09 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT4Q9NX09 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT4Q9NX09 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDIT4Q9NX09 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDIT4Q9NX09 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms