Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf109Q9NX04 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf109Q9NX04 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf109Q9NX04 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms