Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLE1Q9NVX2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLE1Q9NVX2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms