Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS9Q9NV88 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS9Q9NV88 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS9Q9NV88 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
INTS9Q9NV88 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS9Q9NV88 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS9Q9NV88 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS9Q9NV88 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS9Q9NV88 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
INTS9Q9NV88 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
INTS9Q9NV88 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
INTS9Q9NV88 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms