Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHPT1Q9NRX4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHPT1Q9NRX4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHPT1Q9NRX4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHPT1Q9NRX4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHPT1Q9NRX4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHPT1Q9NRX4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHPT1Q9NRX4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHPT1Q9NRX4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms