Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms