Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TLR9Q9NR96 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR9Q9NR96 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms