Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL47Q9HD33 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL47Q9HD33 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL47Q9HD33 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms