Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK4Q9HAZ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK4Q9HAZ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK4Q9HAZ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms